Ellinor synes det er vanskelig å være kjæreste med Andar når de bor så langt fra hverandre. Andar, som fortsatt er svekket etter en skade, må bo i Karasjok. Ellinor drømmer om hvor fint livet skal bli når hun blir gammel nok til å flytte hjemmefra. Men en uventet hendelse ødelegger alt. Voldsomme krefter setter kjærligheten på prøve. Klarer de å overkomme vanskelighetene, og har de mot nok til å møte det som kommer når liv står på spill? Gjennom mørket er en frittstående oppfølger til Under lyset (2017), som handler om tenåringene Ellinor og Andar og deres kamp mot onde krefter.