Bonapartes felttog var den første store konfrontasjonen mellom Islam og Europa i moderne tid. I lys av den franske revolusjon var ett av målene med okkupasjonen å bringe opplysningstidens idealer til Midt-Østen. I det lyktes man ikke, skjønt Bonaparte var fullt inneforstått med de konflikter religion og kultur ville komme til å representere. Bonaparte valgte følgelig å erobre Egypt i Allahs navn. Han kalte seg "Allahs utvalgte!"