I 2025 retter USAs president Donald Trump siktet mot landets eldste universitet, Harvard. Den danske statsvitenskapsstudenten Emil Sondaj Hansen opplever det historiske oppgjøret mellom vitenskap og makt på nært hold. Konflikten kryper inn under huden på ham og fører til at han stiller seg spørsmål som sjelden dukker opp i et demokrati: Kan jeg si hva jeg mener? Tør jeg oppholde meg i nærheten av en demonstrasjon? 

Angrep på Harvard  er en øyenvitneskildring fra et polarisert USA. Den handler ikke bare om et universitet, men også om en splittet nasjon hvor frontene er harde og institusjonen vakler. Emil Sondaj Hansen reiser langs den amerikanske østkysten fra Vermont til Washington D.C., snakker med servitører og statsledere og trekker veksler på sin kunnskap om internasjonal politikk. Resultatet er både et bilde av den skremmende utviklingen han er vitne til i Trumps USA, og et politisk opprop til Europa om å forsvare friheten før den går tapt.