Nils Arne Eggen skapte tidenes idrettseventyr i Trøndelag. Rosenborg ble suverene i Norge, deretter Nordens flaggskip og like før årtusenskiftet blant Europas beste fotballag. Suksessen gjorde klubben styrtrik. I 2002 sa Eggen takk for seg. Dette er boka om hva som skjedde etterpå. Da kontinuitet ble erstattet av gjentatte trenerbytter og lederskifter. Da RBK gikk fra å være i en økonomisk særstilling til å måtte ty til sluttpakker og investorhjelp. Og da åpenhet og hjertevarme ble erstattet med moralsk forfall. Rosenborg forsvant ikke bare fra det gode selskap i Europa. De mistet også det sportslige hegemoniet i Norge. Nå forsøker klubben å finne tilbake suksessoppskriften. I Skyggen av Eggen er den usminkede historien om hva som har skjedd i Norges største fotballklubb etter årtusenskiftet. Hovedpersonen er mannen som ga seg for tolv år siden: Nils Arne Eggen.