Hele planen til Hari Seldon står i fare og jakten på den mystiske andre stiftelsen begynner. Det er en hemmelig organisasjon som Seldon også opprettet, men som få kjenner til. Mens den første stiftelsen fokuserer på teknologi og vitenskap, har den andre stiftelsen spesialisert seg på mental kontroll og psykohistorie. Boken følger både Muleselets desperate søk etter den andre stiftelsen, og Stiftelsens eget forsøk på å forstå og finne denne skjulte kraften. Samtidig prøver den andre stiftelsen å gjenopprette Seldons opprinnelige plan og sikre menneskehetens fremtid.

Den andre Stiftelsen er tredje bind i serien om Stiftelsen.